Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms