Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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COPS7AQ9UBW8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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