Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RB1CC1Q8TDY2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms