Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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