Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms