Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LTC4SQ16873 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms