Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms