Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEC23BQ15437 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms