Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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SCGB2A2Q13296 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SCGB2A2Q13296 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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