Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ERVS71-1P61550 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms