Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PITPNBP48739 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms