Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms