Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMPCBO75439 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.8 ms