Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms