Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms