Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms