Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRP1Q9C000 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms