Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms