Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAP1L3Q99457 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms