Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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