Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms