Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms