Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EGR3Q06889 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms