Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms