Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ABCE1P61221 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms