Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK1P39086 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms