Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBRP36941 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms