Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms