Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNAP12004 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms