Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRFP10586 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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