Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRLO75368 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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