Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD54BQ9Y620 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms