Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP3Q8WYN3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms