Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID2Q8N945 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms