Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms