Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms