Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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