Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms