Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms