Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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