Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms