Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC7AQ9ULT0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms