Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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