Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms