Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SYT9Q86SS6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SYT9Q86SS6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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SYT9Q86SS6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYT9Q86SS6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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