Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SMARCD3Q6STE5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SMARCD3Q6STE5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SMARCD3Q6STE5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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