Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms