Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms