Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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