Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms